Infektionsimmunologie (Infection & Immunity)
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Die Arbeitsgruppe "Infektion & Immunität" konzentriert sich auf die Erforschung der Wirtsantwort auf Infektion und Impfung im Rahmen von Kohortenstudien am Menschen mit Schwerpunkt auf SARS-CoV2-Infektionen, dem Humanen Immundefizienz-Virus (HIV), onkogenen Humanen Papillomaviren (HPV), Mycobacterium tuberculosis (MTB) und Helmintheninfektionen (gemeinsam mit AG Inge Kroidl). Dazu gehören die molekulare Charakterisierung des infektiösen Erregers, die Identifizierung von Korrelaten des Immunschutzes vor Infektion und Krankheitsverlauf, die Entdeckung von Biomarkern für die TB-Diagnostik und Therapieüberwachung, die Charakterisierung von HIV-Reservoiren sowie die Kartierung von B-Zell-Epitopen nach Impfung. Neben der Analyse systemischer zellulärer und humoraler Immunantworten verfügt die Gruppe über Kenntnisse in der Analyse von Effektorzelluntergruppen in menschlichen Gewebeproben mittels Multiplex-Fluoreszenz-Immunhistochemie in Kombination mit dem Nachweis viraler Nukleinsäuren mittels In-situ-Hybridisierung zur Untersuchung der Mikroumgebung virusinfizierter Zellen. Die Fähigkeit zur bioinformatischen Analyse großer RNA-Sequenzierungsdaten und Mikroskopiebilder wird weiter ausgebaut.
Immunologisches Labor und Arbeitsbereiche
Neben der reinen Forschungstätigkeit bieten wir auch GCP-konforme Labordienstleistungen für Partner aus der biomedizinischen Industrie während der klinischen Phase 1 bis Phase 3 von Impfstoffstudien an. Dazu gehören das Management von Prüfpräparaten, die Verarbeitung von Humanproben, Biobanking und internationale Probenlogistik. Dazu gehört die Aufbereitung von Blutproben (Plasma, Serum, Isolierung peripherer mononukleärer Blutzellen). Die Gruppe hat auch große Erfahrung in der Unterstützung großer internationaler klinischer Studien mit einem besonderen Schwerpunkt auf Afrika. Wir bieten daher Unterstützung bei der Proben- und Reagenzienlogistik, dem Aufbau von Kapazitäten und dem Analyseprozess in verschiedenen nationalen und internationalen Studien. Bitte kontaktieren Sie uns für weitere Informationen.
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LeitungPD Dr. rer. nat. Christof GeldmacherUnit Head - Forschungsgruppe "Infection and Immunity"Dr. rer. nat. Kathrin HeldUnit Head - Forschungsgruppe "Infection and Immunity"TeamMohamed Ahmed, PhDPostdocDr. rer. nat. Olga BaranovBioinformatics ManagerÉäxgsAgpguüqvim ful+vf:iuyziu-mWiNadja Bräuercand. rer. nat.Tgmk:gsApgifipvimsfulrvf:;iuyziJuemiClaudia Bräu-HebergerCTA, ForschungDr. Mkunde ChachagePhD, MSc, NIMR-Mbeya Medical Research Center, TansaniaTabea Esercand. rer. nat.Luming LinPhD StudentinMairi McCleanPhD candidateOglpl OJJyyäiguvim-fauldrvfiuyziu miDr. rer. nat. Wilbert MbuyaNIMR-Mbeya Medical Research Center, TansaniaSabine RappeMTLA, ForschungDanni Wang, MSccand. rer. nat.MguulsUguxvimeful_vfiuyziu miDoktorand:innen, PhD, Master und Bachelor-StudierendeIsabel Brandcand. med. n.n.Nadja Bräuercand. rer. nat.Tgmkg-Apgifipnvim fulrvfiuyziDusmiLeonard Gilbertcand. med. n.n.Augusta Horvathcand. med. n.n.Yuka Nadaicand. med. n.n.Nora Pierothcand. med. n.n.Alumni
Nadia Sitoe, Promotion 2023, Titel der Arbeit: " Inflammatory and prognostic biomarkers associated with pulmonary tuberculosis long-term sequelae after TB treatment in relation to HIV status and lung impairment"
Wilbert Mbuya, Promotion 2022, Titel der Arbeit: "Dissecting the Influence of Human Immunodeficiency Virus Type 1 on Human Papilloma Virus Infection, Disease and Immunity"
Caleb Mufong, Gambia, Promotion 2022, Titel der Arbeit: "Defining The Inflammatory Pathway And Prognostic Neutrophil-derived Biomarkers Associated With Pulmonary Morbidity And Long-Term Outcome Of Patients Following TB Therapy"
Astrid Hielscher, Deutschland, Promotion 2020, Titel der Arbeit: "Phylogenetic comparison of plasma- and cell subset derived viral sequences to identify the cellular origin of HIV plasma viremia"
Mohamed Ahmed aus Ägypten, PhD Abschluss 2019, Titel der Arbeit: “Exploring sputum independent host biomarkers for detection of Tuberculosis disease and monitoring treatment”
Rebecca Loose, Deutschland, Bachelor-Abschluss 2017, Titel der Arbeit: "Assessing novel Bioinformatic approaches for analyses of polychromatic flow cytometry data"
Krutarth Patel, Deutschland, PhD Abschluss 2017, Titel der Arbeit: "Development and evaluation of a urine based rapid molecular diagnostic test for pulmonary tuberculosis with potential for point of care: Cape Town cohort"
Mohamed Ahmed aus Ägypten, Master-Abschluss 2015, Titel der Arbeit: “Dissecting the dynamics of the Envelope-specific IgG response over the course of HIV infection“
Mkunde Chachage aus Tansania, PhD-Abschluss 2013, Titel der Arbeit: „Immune system modulation by Infections with Helminths and HIV-1: Impact on pathogen-specific T cell responses, regulatory T cells and systemic Immune activation“
Francesco Nicoli aus Italien, PhD-Abschluss 2013, Titel der Arbeit: „Immunogenicity and immunomodulatory properties of the HIV-1 Tat protein“
Ivy Gloria Mensah from Ghana, PhD student from 2010 to 2014. Graduated September 2014. Thesis title: „Biomarkers for disease progression and treatment; immunological profiles in individuals infected by different species of the Mycobacterium tuberculosis complex in Ghana“
Leigh-Anne Eller aus USA, PhD-Abschluss 2014, Titel der Arbeit: “Acute HIV infection in non-subtype B populations: Viral dynamics, laboratory staging and early detection“
Myrna Benninghoff, Germany, Promotion 2015, Titel der Arbeit: „Etablierung und Validierung eines molekularen Wurmdiagnostik-verfahrens am NIMR-MMRC Labor in Mbeya, Tansania: Stellenwert der Real- Time PCR in der Diagnostik von Wurmerkrankungen - Evaluierung und Ausblick“
Felicien Moukambi aus Gabun, Master-Abschluss 2012, Titel der Arbeit: “Development and Optimization of a flow cytometry based (TAM-IGRA) method to study phenotypic and functional changes on Mycobacterium tuberculosis-specific T cells in order to identify potential diagnostic markers to discriminate active and latent Tuberculosis“
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Forschungstechnologieplattformen und Labordienstleistungen
Polychromatische Durchflusszytometrie und durchflusszytometrische Zellsortierung zur eingehenden Charakterisierung menschlicher ZellenDas Labor ist mit einem 13-Farben Beckmann Coulter CytoFLEX Durchflusszytometer ausgestattet und verfügt über große Erfahrung in der durchflusszytometrischen Analyse menschlicher Zellen. Dazu gehört die Charakterisierung von pathogen-spezifischen T-Zellen nach in vitro Restimulation oder durch HLA-Tetramer-Färbung sowie aller anderen Zelltypen im Blut. Das Labor verwendet die Durchflusszytometrie-Kerneinheit CyTUM-MIH (Weblink: http://www.fcfu.mikrobio.med.tum.de/CyTUM-MIH/home) für die durchflusszytometrische Zellsortierung auf Biosicherheitsstufe S2 und S3, um nachgeschaltete Analysen von DNA und RNA in sortierten Zellen zu ermöglichen.
Peptid-Mikroarray-Analysen von erregerspezifischen AntikörperreaktionenDas Labor dient als zentrales Peptidarray-Labor für die European HIV Vaccine Alliance (http://www.ehv-a.eu/). Wir verwenden ein vollständig validiertes Peptid-Mikroarray-Assay zur Kartierung und Analyse spezifischer antigener Regionen, die von den durch die Impfung ausgelösten Antikörpern erkannt werden. Die Technologie ist sowohl für klinische als auch für präklinische Proben geeignet. Die Technologie ermöglicht Reaktivitätstests gegen bis zu 8000 verschiedene Peptide in dreifacher Ausführung in mehreren Proben gleichzeitig. Das Design des Peptid-Microarrays wird in Zusammenarbeit mit Dr. Georgios Pollakis (Universität Liverpool, weblink https://www.liverpool.ac.uk/infection-and-global-health/staff/georgios-pollakis/publications/) durchgeführt. Die nachgelagerte bioinformatische Analyse der generierten Daten ist gut etabliert und kann je nach Forschungsfrage angepasst werden.
Histologische Charakterisierung von gewebeansässigen Zellen in ihrer natürlichen MikroumgebungHistologische Verfahren liefern wertvolle Informationen über die Zellen in ihrer natürlichen Umgebung, z. B. über ihre relative Position im Gewebe und über Zell-Zell-Interaktionen. Um diese Informationen zu nutzen, hat das Labor die Multiplex-Fluoreszenz-Immunhistochemie für zahlreiche Zellmarker in Kombination mit dem Nachweis von Nukleinsäuren durch In-situ-Hybridisierung eingeführt. Für die gängigsten Färbepanels sind anpassbare halbautomatische Analysetools etabliert. Über die Core Facility Bioimaging am Biomedizinischen Zentrum (BMC) (https://www.bioimaging.bmc.med.uni-muenchen.de/index.html) haben wir je nach Anwendung Zugang zu verschiedenen Mikroskopen.Transkriptomanalyse durch RNA-SequenzierungDie Transkriptomanalyse ist im Labor gut etabliert, wobei die bioinformatischen Arbeitsabläufe im Haus entwickelt wurden. Ein besonderer Schwerpunkt unserer Forschung ist die Analyse von Zellpopulationen mit geringer Häufigkeit, um neue Biomarker zu entdecken. Wir verfügen über Fachwissen in der Hochdurchsatzanalyse von Vollblut, das in klinischen Versuchen und Beobachtungsstudien gesammelt wurde, sowie in der RNA-Sequenzierung von sortierten seltenen Zellpopulationen wie pathogenspezifischen T-Zellen mit geringem Durchsatz.
Labordienstleistungen, Beratungsdienste und internationale klinische StudienlogistikDas Labor kann Labordienstleistungen für die Verarbeitung und Analyse von Humanproben für klinische Studien in München und anderswo anbieten. Dazu gehört die Aufbereitung von Blutproben (Plasma, Serum, Isolierung peripherer mononukleärer Blutzellen). Die Gruppe hat auch große Erfahrung in der Unterstützung großer internationaler klinischer Studien mit einem besonderen Schwerpunkt auf Afrika. Wir bieten daher Unterstützung bei der Proben- und Reagenzienlogistik, dem Aufbau von Kapazitäten und dem Analyseprozess in verschiedenen nationalen und internationalen Studien. Bitte kontaktieren Sie uns für weitere Informationen.
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Laufende Projekte
- Langfristige Nachverfolgung der zellulären und humoralen Immunantwort nach SARSCoV-2-Infektion
- The 2H study: Influence of HIV and treatment with ART on HPV-specific infection, disease and immunity
- iCTU - HIV
- TTU-HIV: Immune control of HIV-1
- TB-personalized medicine
- RaPaed – WP4 TB Novel Diagnostics in children
- African Cohort Study (AFRICOS), vgl. Pressemitteilung: Ein Blick ins Innere: Blutbasierte Biomarker könnten die Früherkennung einer beginnenden Tuberkulose bei Menschen mit HIV erleichtern, LMU Klinikum, 13.07.2022
- ERASE TB – WP3 TB Novel Diagnostics
- DZIF Maternity Leave Stipend - Transcriptomic profiling of MTB-specific T cells to identify novel biomarkers for Tuberculosis disease progression and outcome
- DZIF Application for investment goods
- DFG Systems Epidemiological analysis of the COVID-19 PANdemic accounting for host-virus interaction and human behavior (SEPAN)
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Die Arbeitsgruppe ist eng mit der internationalen Clinical Trials Unit des Deutschen Zentrums für Infektionsforschung (DZIF) verbunden und trägt zur Probenverarbeitung und zum Biobanking bei großen internationalen klinischen Studien und Beobachtungsstudien bei. Die Gruppe arbeitet eng mit dem NIMR-Mbeya Medical Research Center in Mbeya, Tansania, und dem Instituto Nacional de Saúde in Maputo, Mosambik, sowie mit anderen afrikanischen Forschungszentren zusammen, um die Kapazitäten für die Erforschung von Infektionskrankheiten in endemischen Gebieten auf dem afrikanischen Kontinent zu verbessern.
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Wichtigste Förderorganisationen: DZIF, DFG, EU Horizon 2020, EDCTP
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Publikationen (Auswahl)
Nucleocapsid-specific T cell responses associate with control of SARS-CoV-2 in the upper airways before seroconversion.
Eser, T.M., Baranov, O., Huth, M. et al.
Nat Commun 14, 2952 (2023). doi: 10.1038/s41467-023-38020-8Therapeutic Efficacy of a VSV-GP-based Human Papilloma Virus Vaccine in a Murine Cancer Model.
Riepler L, Frommelt LS, Wilmschen-Tober S, Mbuya W, Held K, Volland A, von Laer D, Geldmacher C, Kimpel J.
Journal of Molecular Biology, Vol. 435, Issue 13, 2023, 168096, ISSN 0022-2836Impact of Omicron Variant Infection on Assessment of Spike-Specific Immune Responses Using the EUROIMMUN Quan-T-Cell SARS-CoV-2 Assay and Roche Elecsys Anti-SARS-CoV-2-S.
Ahmed MIM, Plank M, Castelletti N, Diepers P, Eser TM, Rubio-Acero R, Norena I, Reinkemeyer C, Zapf D, Hoelscher M, Janke C, Wieser A, Geldmacher C, On Behalf Of The KoCo/Orchestra Study G.
Diagnostics (Basel). 2023; 13.
Systematic comparison of HIV-1 Envelope-specific IgG responses induced by different vaccination regimens: Can we steer IgG recognition towards regions of viral vulnerability?
Horvath A, Rogers L, Pollakis G, Baranov O, Pieroth N, Joseph S, Chachage M, Heitzer A, Maganga L, Msafiri F, Joachim A, Viegas E, Eller L-A, Kibuuka H, Rerks-Ngarm S, Pitisuttithum P, Nitayapan S, Dhitavat J, Premsri N, Fidler S, Shattock R J., Robb M L, Weber J, McCormack S, Munseri P J, Lyamuya E, Nilsson C, Kroidl A, Hoelscher M, Wagner R, Geldmacher C, Held K
Front. Immunol., 2023, Jan 09,13. doi: 10.3389/fimmu.2022.1075606Distinct and dynamic activation profiles of circulating dendritic cells and monocytes in mild COVID-19 and after yellow fever vaccination.
Winheim E, Eser T, Deak F, Ahmed MIM, Baranov O, Rinke L, Eisenacher K, Santos-Peral A, Karimzadeh H, Pritsch M, Scherer C, Muenchhoff M, Hellmuth JC, von Bergwelt-Baildon M, Olbrich L, Hoelscher M, Wieser A, Kroidl I, Rothenfusser S, Geldmacher C, Krug AB.
Eur J Immunol. 2023. (IF 6,688)Enhanced Spike-specific, but attenuated Nucleocapsid-specific T cell responses upon SARS-CoV-2 breakthrough versus non-breakthrough infections.
Ahmed MIM, Diepers P, Janke C, Plank M, Eser TM, Rubio-Acero R, Fuchs A, Baranov O, Castelletti N, Kroidl I, Olbrich L, Bauer B, Wang D, Prelog M, Liese JG, Reinkemeyer C, Hoelscher M, Steininger P, Uberla K, Wieser A, Geldmacher C.
Front Immunol. 2022; 13: 1026473. (IF 8,786)Long-term follow-up on HIV infected and non-infected women with cervical cancer from Tanzania: staging, access to cancer-directed therapies and associated survival in a real-life remote setting.
Glasmeyer L, McHaro RD, Torres L, Lennemann T, Danstan E, Mwinuka N, Judick M, Mueller W, Mbuya W, Holscher M, Lelle R, Geldmacher C, Kroidl A, France JR.
BMC Cancer. 2022; 22: 12. (IF 4,638)Assessment of tuberculosis disease activity in people infected with Mycobacterium tuberculosis and living with HIV: A longitudinal cohort study.
Kroidl I, Ahmed M, Horn S, Polyak C, Esber A, Parikh A,Eller L A, Kibuuka H, Semwogerere M, Mwesigwa B, Naluyima P, Kasumba J M, Maswai J, Owuoth J, Sing’oei V, Rono E, Loose R, Hoelscher M, Ake J, Geldmacher C, on behalf of the AFRICOS Study Group.
eClinicalMedicine 2022;00: 101470. doi:10.1016/j.eclinm.2022.101470The interplay of viral loads, clinical presentation, and serological responses in SARS-CoV-2 - Results from a prospective cohort of outpatient COVID-19 cases.
Puchinger K, Castelletti N, Rubio-Acero R, Geldmacher C, Eser TM, Deák F, Paunovic I, Bakuli A, Saathoff E, von Meyer A, Markgraf A, Falk P, Reich J, Riess F, Girl P, Müller K, Radon K, Guggenbuehl Noller JM, Wölfel R, Hoelscher M, Kroidl I, Wieser A, Olbrich L; KoCo19 study group.
Virology. 2022 Feb 18;569:37-43. doi: 10.1016/j.virol.2022.02.002. Online ahead of print.PMID: 35245784 Free PMC article.Protective immune trajectories in early viral containment of non-pneumonic SARS-CoV-2 infection.
Pekayvaz K, Leunig A, Kaiser R, Joppich M, Brambs S, Janjic A, Popp O, Nixdorf D, Fumagalli V, Schmidt N, Polewka V, Anjum A, Knottenberg V, Eivers L, Wange LE, Gold C, Kirchner M, Muenchhoff M, Hellmuth JC, Scherer C, Rubio-Acero R, Eser T, Deák F, Puchinger K, Kuhl N, Linder A, Saar K, Tomas L, Schulz C, Wieser A, Enard W, Kroidl I, Geldmacher C, von Bergwelt-Baildon M, Keppler OT, Munschauer M, Iannacone M, Zimmer R, Mertins P, Hubner N, Hoelscher M, Massberg S, Stark K, Nicolai
L.Nat Commun. 2022 Feb 23;13(1):1018. doi: 10.1038/s41467-022-28508-0.PMID: 35197461 Free PMC article.SARS-CoV-2 Beta variant infection elicits potent lineage-specific and cross-reactive antibodies.
Reincke SM, Yuan M, Kornau HC, Corman VM, van Hoof S, Sánchez-Sendin E, Ramberger M, Yu W, Hua Y, Tien H, Schmidt ML, Schwarz T, Jeworowski LM, Brandl SE, Rasmussen HF, Homeyer MA, Stöffler L, Barner M, Kunkel D, Huo S, Horler J, von Wardenburg N, Kroidl I, Eser TM, Wieser A, Geldmacher C, Hoelscher M, Gänzer H, Weiss G, Schmitz D, Drosten C, Prüss H, Wilson IA, Kreye J.
Science. 2022 Feb 18;375(6582):782-787. doi: 10.1126/science.abm5835. Epub 2022 Jan 25.PMID: 35076281HPV Type Distribution in HIV Positive and Negative Women With or Without Cervical Dysplasia or Cancer in East Africa.
Mcharo R, Lennemann T, France J, Torres L, Garí M, Mbuya W, Mwalongo W, Mahenge A, Bauer A, Mnkai J, Glasmeyer L, Judick M, Paul M, Schroeder N, Msomba B, Sembo M, Chiwerengo N, Hoelscher M, Geisenberger O, Lelle RJ, Saathoff E, Maboko L, Chachage M, Kroidl A, Geldmacher C.
Front Oncol. 2021 Nov 30;11:763717. doi: 10.3389/fonc.2021.763717. eCollection 2021.PMID: 34917506 Free PMC article.Major Neutrophil-Derived Soluble Mediators Associate With Baseline Lung Pathology and Post-Treatment Recovery in Tuberculosis Patients.
Muefong CN, Owolabi O, Donkor S, Charalambous S, Mendy J, Sey ICM, Bakuli A, Rachow A, Geldmacher C, Sutherland JS.
Front Immunol. 2021 Nov 23;12:740933. doi: 10.3389/fimmu.2021.740933. eCollection 2021.PMID: 34887853 Free PMC article.Depletion of Human Papilloma Virus E6- and E7-Oncoprotein-Specific T-Cell Responses in Women Living With HIV.
Mbuya W, Held K, Mcharo RD, Haule A, Mhizde J, Mnkai J, Mahenge A, Mwakatima M, Sembo M, Mwalongo W, Agrea P, Hoelscher M, Maboko L, Saathoff E, Geisenberger O, Rwegoshora F, Torres L, Koup RA, Kroidl A, Chachage M, Geldmacher C.
Front Immunol. 2021 Oct 25;12:742861. doi: 10.3389/fimmu.2021.742861. eCollection 2021.PMID: 34759925 Free PMC article.Neutrophils contribute to severity of tuberculosis pathology and recovery from lung damage pre- and post-treatment.
Nwongbouwoh Muefong C, Owolabi O, Donkor S, Charalambous S, Bakuli A, Rachow A, Geldmacher C, Sutherland JS.
Clin Infect Dis. 2021 Aug 24:ciab729. doi: 10.1093/cid/ciab729. Online ahead of print.PMID: 34427644Stepwise Conformational Stabilization of a HIV-1 Clade C Consensus Envelope Trimer Immunogen Impacts the Profile of Vaccine-Induced Antibody Responses.
Hauser A, Carnell G, Held K, Sulbaran G, Tischbierek N, Rogers L, Pollakis G, Tonks P, Hoelscher M, Ding S, Sanders RW, Geldmacher C, Sattentau Q, Weissenhorn W, Heeney JL, Peterhoff D, Wagner R.
Vaccines (Basel). 2021 Jul 6;9(7):750. doi: 10.3390/vaccines9070750.PMID: 34358165 Free PMC article.Cross-reactivity of a pathogenic autoantibody to a tumor antigen in GABAA receptor encephalitis.
Brändle SM, Cerina M, Weber S, Held K, Menke AF, Alcalá C, Gebert D, Herrmann AM, Pellkofer H, Gerdes LA, Bittner S, Leypoldt F, Teegen B, Komorowski L, Kümpfel T, Hohlfeld R, Meuth SG, Casanova B, Melzer N, Beltrán E, Dornmair K. Proc Natl
Acad Sci U S A. 2021HIV DNA reservoir and elevated PD-1 expression of CD4 T-cell subsets particularly persist in the terminal ileum of HIV-positive patients despite cART.
Horn C, Augustin M, Ercanoglu MS, Heger E, Knops E, Bondet V, Duffy D, Chon SH, Nierhoff D, Oette M, Schäfer H, Vivaldi C, Held K, Anderson J, Geldmacher C, Suárez I, Rybniker J, Klein F, Fätkenheuer G, Müller-Trutwin M, Lehmann C.
HIV Med. 2021Flow cytometric analysis of cell lineage and immune activation markers using minimal amounts of human whole blood-Field method for remote settings.
Horn S, Ahmed MIM, Geldmacher C, Marandu TF, Osei-Mensah J, Debrah A, Layland LE, Hoerauf A, Kroidl I.
J Immunol Methods. 2021CD34T+ Humanized Mouse Model to Study Mucosal HIV-1 Transmission and Prevention.
Vanshylla K, Held K, Eser TM, Gruell H, Kleipass F, Stumpf R, Jain K, Weiland D, Münch J, Grüttner B, Geldmacher C, Klein F.
Vaccines (Basel). 2021Serological Protection 5-6 Years Post Vaccination Against Yellow Fever in African Infants Vaccinated in Routine Programmes.
Idoko OT, Domingo C, Tapia MD, Sow SO, Geldmacher C, Saathoff E, Kampmann B.
Front Immunol. 2020Depletion and activation of mucosal CD4 T cells in HIV infected women with HPV-associated lesions of the cervix uteri.
Mbuya W, Mcharo R, Mhizde J, Mnkai J, Mahenge A, Mwakatima M, Mwalongo W, Chiwerengo N, Hölscher M, Lennemann T, Saathoff E, Rwegoshora F, Torres L, Kroidl A, Geldmacher C, Held K, Chachage M.
PLoS One. 2020Induction of Identical IgG HIV-1 Envelope Epitope Recognition Patterns After Initial HIVIS-DNA/MVA-CMDR Immunization and a Late MVA-CMDR Boost.
Joachim A, Ahmed MIM, Pollakis G, Rogers L, Hoffmann VS, Munseri P, Aboud S, Lyamuya EF, Bakari M, Robb ML, Wahren B, Sandstrom E, Nilsson C, Biberfeld G, Geldmacher C and Held K.
Front. Immunol. 2020Wuchereria bancrofti infection is linked to systemic activation of CD4 and CD8 T cells.
Kroidl I, Chachage M, Mnkai J, Nsojo A, Berninghoff M, Verweij JJ, Maganga L, Ntinginya NE, Maboko L, Clowes P, Hoelscher M, Saathoff E and Geldmacher C.
PLoS Negl Trop Dis. 2019Envelope-specific epitope recognition patterns of HIV vaccine-induced IgG antibodies are linked to immunogen structure and sequence.
Nadai Y, Held K, Joseph S, Ahmed MIM, Hoffmann VS, Peterhoff D, Missanga M, Bauer A, Joachim A, Reimer U, Zerweck J, McCormack S, Cope AV, Tatoud R, Shattock RJ, Robb ML, Sandstroem EG, Hoelscher M, Maboko L, Bakari M, Kroidl A, Wagner R, Weber J, Pollakis G, Geldmacher C.
Front Immunol. 2019Communication of CD8 + T Cells With Mononuclear Phagocytes in Multiple Sclerosis.
Kojevic Sabolek M, Held K, Beltrán E, Niedl AG, Meinl E, Hohlfeld R, Lassmann H, Dornmair K
Ann Clin Transl Neurol. 2019Phenotypic Changes on Mycobacterium Tuberculosis-Specific CD4 T Cells as Surrogate Markers for Tuberculosis Treatment Efficacy.
Ahmed MIM, Ntinginya NE, Kibiki G, Mtafya BA, Semvua H, Mpagama S, Mtabho C, Saathoff E, Held K, Loose R, Kroidl I, Chachage M, von Both U, Haule A, Mekota AM, Boeree MJ, Gillespie SH, Hoelscher M, Heinrich N, Geldmacher C.
Front Immunol. 2018Preferential Targeting of Conserved Gag Regions after Vaccination with a Heterologous DNA prime - Modified Vaccinia Ankara (MVA) boost HIV-1 vaccine regimen.
Bauer A, Podola L, Mann P, Missanga M, Haule A, Sudi L, Nilsson C, Kaluwa B, Lueer C, Mwakatima M, Munseri PJ, Maboko L, Robb ML, Tovanabutra S, Kijak G, Marovich M, McCormack S, Joseph S, Lyamuya E, Wahren B, Sandström E, Biberfeld G, Hoelscher M, Bakari M, Kroidl A, Geldmacher C.
J Virol. 2017Effect of Wuchereria bancrofti infection on HIV incidence in southwest Tanzania: a prospective cohort study.
Kroidl I, Saathoff E, Maganga L, Makunde WH, Hoerauf A, Geldmacher C, Clowes P, Maboko L, Hoelscher M.
Lancet. 2016CD25+ FoxP3+ Memory CD4 T Cells Are Frequent Targets of HIV Infection In Vivo.
Chachage M, Pollakis G, Kuffour EO, Haase K, Bauer A, Nadai Y, Podola L, Clowes P, Schiemann M, Henkel L, Hoffmann D, Joseph S, Bhuju S, Maboko L, Sarfo FS, Eberhardt K, Hoelscher M, Feldt T, Saathoff E, Geldmacher C.
J Virol. 2016CTLA4 as Immunological Checkpoint in the Development of Multiple Sclerosis.
Gerdes LA*, Held K*, Beltran E*, Berking C, Prinz JC, Junker A, Tietze JK, Ertl-Wagner B, Straube A, Kuempfel T, Dornmair K*, Hohlfeld R*
Ann Neurol. 2016Commentary: First-in-human trial of a live-attenuated Mycobacterium tuberculosis vaccine.
Geldmacher C, Hatherill M.
Lancet Respir Med. 2015Commentary: Early Identification of Progressive TB Disease Using Host Biomarkers.
Rachow A, Heinrich N, Geldmacher C
EBioMedicine. 2015αβ T-cell receptors from multiple sclerosis brain lesion show MAIT cell-reladed features.
Held K, Bhonsle-Deeng L, Siewert K, Sato W, Beltrán E, Schmidt S, Rühl G, Ng JKM, Engerer P, Moser M, Klinkert WEF, Babbe H, Misgeld T, Wekerle H, Laplaud DA, Hohlfeld R, Dornmair K
Neurol N2. 2015Assessment of the novel T-cell activation marker-tuberculosis assay for diagnosis of active tuberculosis in children: a prospective proof-of-concept study.
Portevin D, Moukambi F, Clowes P, Bauer A, Chachage M, Ntinginya NE, Mfinanga E, Said K, Haraka F, Rachow A, Saathoff E, Mpina M, Jugheli L, Lwilla F, Marais BJ, Hoelscher M, Daubenberger C, Reither K*, Geldmacher C*.
Lancet Infect Dis. 2014Helminth-Associated Systemic Immune Activation and HIV Co-receptor Expression: Response to Albendazole/Praziquantel Treatment.
Chachage M, Podola L, Clowes P, Nsojo A, Bauer A, Mgaya O, Kowour D, Froeschl G, Maboko L, Hoelscher M, Saathoff E, Geldmacher C.
PLoS Negl Trop Dis. 2014Interaction between HIV and Mycobacterium tuberculosis: HIV-1-induced CD4 T-cell depletion and the development of active tuberculosis.
Geldmacher C, Zumla A, Hoelscher M.
Curr Opin HIV AIDS. 2012Pathogen-specific T cell depletion and reactivation of opportunistic pathogens in HIV infection.
Geldmacher C, Koup RA.
Trends Immunol. 2012 May;33(5):207-14Expression of herpes simplex virus 1-encoded microRNAs in human trigeminal ganglia and their relation to local T-cell infiltrates.
Held K, Junker A, Dornmair K, Meinl E, Sinicina I, Brandt T, Theil D, Derfuss T
J Virol. 2011Preferential infection and depletion of Mycobacterium tuberculosis-specific CD4 T cells after HIV-1 infection.
Geldmacher C, Ngwenyama N, Schuetz A, Petrovas C, Reither K, Heeregrave EJ, Casazza JP, Ambrozak DR, Louder M, Ampofo W, Pollakis G, Hill B, Sanga E, Saathoff E, Maboko L, Roederer M, Paxton WA, Hoelscher M, Koup RA.
J Exp Med. 2010Minor viral and host genetic polymorphisms can dramatically impact the biologic outcome of an epitope-specific CD8 T-cell response.
Geldmacher C, Metzler IS, Tovanabutra S, Asher TE, Gostick E, Ambrozak DR, Petrovas C, Schuetz A, Ngwenyama N, Kijak G, Maboko L, Hoelscher M, McCutchan F, Price DA, Douek DC, Koup RA.
Blood. 2009SIV-specific CD8+ T cells express high levels of PD1 and cytokines but have impaired proliferative capacity in acute and chronic SIVmac251 infection.
Petrovas C, Price DA, Mattapallil J, Ambrozak DR, Geldmacher C, Cecchinato V, Vaccari M, Tryniszewska E, Gostick E, Roederer M, Douek DC, Morgan SH, Davis SJ, Franchini G, Koup RA.
Blood. 2007CD8 T-cell recognition of multiple epitopes within specific Gag regions is associated with maintenance of a low steady-state viremia in human immunodeficiency virus type 1-seropositive patients.
Geldmacher C, Currier JR, Herrmann E, Haule A, Kuta E, McCutchan F, Njovu L, Geis S, Hoffmann O, Maboko L, Williamson C, Birx D, Meyerhans A, Cox J, Hoelscher M.
J Virol. 2007 -
News
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Infection & Immunity working group - Research Interests
The "Infection & Immunity" work group concentrates on dissecting the host response to infection and vaccination during human cohort studies with primary focus on SARS-CoV2 infection, the Human Immunodeficiency Virus (HIV), oncogenic Human Papilloma Viruses (HPV), Mycobacterium tuberculosis (MTB) and helminth infections (together with AG Inge Kroidl). This includes the molecular characterization of the infecting pathogen, identification of correlates of immune protection from infection and disease progression, biomarker discovery for TB diagnostics and treatment monitoring, characterization of HIV reservoirs, as well as mapping of B cell epitopes upon vaccination. Besides the analysis of systemic cellular and humoral immune responses, the group has proficiency in the analysis of effector cell subsets in human tissue samples using multiplex fluorescence immunohistochemistry combined with detection of viral nucleic acids using in situ hybridization to study the micro-environment of virus-infected cells. The capacity for bioinformatic analysis of large-scale RNA sequencing data and microscopy images is undergoing further development.
The working group is closely affiliated with the international Clinical Trials Unit from the German Center for Infection Research (DZIF) and contributes to human subject specimen processing and biobanking during large international clinical trials and observational studies. The group collaborates closely with the NIMR-Mbeya Medical Research Center in Mbeya, Tanzania and the Instituto Nacional da Saude in Maputo, Mozambique as well as other African Research Centers to support improving the capacity for infectious disease research in endemic settings on the African continent.
Besides pure research activities, we also offer GCP conform laboratory services to partners from the biomedical industry during clinical phase 1 to phase 3 vaccine trials. This includes management of investigational medical products, human sample processing, biobanking and international sample logistics.
Research Technology Platforms and Laboratory services
Platform: Polychromatic flow cytometry and flow cytometric cell sorting for in-depth characterization of human cellsThe laboratory is equipped with a 13-colour Beckmann Coulter CytoFLEX Flow Cytometer and has vast experience in the flow cytometric analysis of human cells. This includes characterisation of pathogen-specific T cells after in vitro restimulation or by HLA tetramer staining as well as any other cell type in the blood. The laboratory uses the Flow Cytometry core unit CyTUM-MIH for flow cytometric cell sorting at biosafety S2 and S3 level to allow for downstream analyses of DNA and RNA in sorted cells.
Platform: Peptide microarray analyses of pathogen-specific antibody responsesThe laboratory serves as a core peptide array laboratory for the European HIV Vaccine Alliance. We use a fully validated peptide microarray assay to map and analyse specific antigenic regions recognized by antibodies elicited by vaccination. The technology is established for both, clinical and preclinical specimen. The technology allows reactivity testing against up to 8000 different peptides in triplicates in multiple samples simultaneously. Custom design of the peptide microarray is performed in collaboration with Dr. Georgios Pollakis (University of Liverpool). Bioinformatic downstream analysis of generated data is well established and can be adapted depending on the research question.
Platform: Histological characterisation of tissue-resident cells in their natural microenvironmentHistological techniques provide valuable information on cells within their natural environment, such as their relative positioning within the tissue and cell-cell interactions. To take advantage of this information, the laboratory thas established multiplex fluorescence immunohistochemistry for numerous cell markers in combination with the detection of nucleic acids using in situ hybridisation. Customisable semi-automated analysis tools are established for the most common staining panels. We have access to various microscopes via the Core Facility Bioimaging at the Biomedical Center (BMC), depending on the application in question.
Platform: Transcriptome analysis by RNA sequencingTranscriptome analysis is well established within the lab, with bioinformatic workflows developed in house. A particular focus of our research includes the analysis of low abundant cell populations for the discovery of novel biomarkers. We have expertise in high-throughput analysis of whole blood collected in clinical trials and observational studies as well as in low-input RNA sequencing of sorted rare cell populations such as pathogen-specific T cells.
Laboratory services, Consultancies and international clinical study logisticsThe laboratory can provide laboratory services for human sample processing and analysis for clinical studies in Munich and elsewhere. This includes the processing of blood samples (Plasma, Serum, Isolation of Peripheral Blood Mononuclear Cells). The group also has tremendous experience in supporting large international clinical with a specific emphasis on Africa. We therefore provide support on sample and reagent logistics, capacity development and the analytic process in multiple national and international study set ups. Please contact us for more information.