Zu den Aufgaben des Instituts für Klinische Neuroimmunologie gehört die Diagnostik und Behandlung von Autoimmunerkrankungen des Nervensystems. Autoimmunerkrankungen sind Krankheiten, bei denen sich das Immunsystem gewissermaßen irrtümlich gegen Substanzen des eigenen Körpers richtet ("autos" ist das griechische Wort für "selbst"). Die häufigste neurologische Autoimmunerkrankung ist die Multiple Sklerose.