Neue analytische und diagnostische Verfahren in der Infektions- und Tropenmedizin
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Der Fokus der Arbeitsgruppe liegt auf der Entwicklung neuer Techniken zur Untersuchung bakterieller und viraler Pathogenität und der Wirksamkeit von antimikrobiellen/-viralen Substanzen. Schwerpunkte der Forschungs- und Entwicklungsarbeit sind dabei die Aufdeckung von metabolischer Aktivität von (einzelnen) Organismen unter Therapie. Hierbei kommen hauptsächlich massenspektrometrisch basierte Techniken (z.B. MALDI-TOF-MS, LC-MS/MS in Kombination mit Stabilisotopenmarkierung), spektroskopische Verfahren (z.B. RAMAN), mikroskopische Verfahren (z.B. Fluoreszenz), Mikrofluidik-basierte Techniken, gentechnische Verfahren (Vektordesign, GVO), Arthropoden/Vektoren – neue Techniken in der Vektorbiologie; serologische Techniken und Verfahren zum Immunomonitoring von SARS-CoV-2 Infektionen.
Die Forschungsgruppe entwickelte außerdem ein Abwasser-Monitoring Protokoll, das seit April 2020 umgesetzt wurde und wöchentlich die Last von SARS-CoV-2 Viren im Abwasser an 6 verschiedenen Stellen des Münchner Abwassernetzes bestimmt (weitere Informationen: vgl. Projekte).
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LeitungPD Dr. med. Andreas WieserOberarzt, Arbeitsgruppenleiter, Stellv. Laborleitung DiagnostikDr. Anna-Cathrine Neumann-CipWissenschaftliche Mitarbeiterin, Stellv. ArbeitsgruppenleiterinWissenschaftliche Mitarbeiter:innen/PostDocsRaquel Rubio-Acero, PhDBiologin, PostDoc+49 (0)89 4400 59858pgæfiä pfjlüvimWeful_vfiuyziu miJessica Beyerl, MScWissenschaftliche MitarbeiterinQicclygsAiјipävim-ful_vfiuyziu miDr. rer. nat. Noemi CastellettiHead of the Data Science UnitTüivlYeHgcbSiäälbblvimtfDulGvfiuyziu-miDr. Susanna OswaldWissenschaftliche Mitarbeiterin, Fraunhofer-Institut für Translationale Medizin und Pharmakologie ITMP-IIPDr. Florian OppererWissenschaftlicher Mitarbeiter, TUM/LMU Klinikum KooperationsprojektTechnisches PersonalIrene KottaMTLAlpniu;i oübbgvimtfulrvfiuyziu-miNiculina KriewallBTAGabriele LieglMTLA, Max von Pettenkofer-Institut der LMUSarah SternkopfBTAAngelika ThomschkeCTAFWuxiäloDg-KzüvScyzoivim fulhvfiuyziuemiPhD Studierende/Doktorand:innenAikins Ablorde, MScGhana, PhD StudentAnja Dollinger, MScDoktorandinFukgeMüääluxSipvim fulhvfiuyziu-miEva Krois, MScDoktorandin, Kooperation mit TUMAmelie Hohensee, MScDoktorandin, Kooperation mit TUM analytische Chemie (Prof. Dr. C. Haisch)Fviäli-ZüziucYiiv:imsnful_vfiuyziu-miJasmin Javanmardi, MScDoktorandin (INSIDe)QgcvlueQgqWguvgpmlvim/f:ul_nvfiuyziu-miSatyajit Nanda, MScDoktorandJessica Neusser, MScDoktorandin, Kooperation mit dem Bayerischen Landesamt für Gesundheit und Lebensmittelsicherheit (LGL)Dorothy Obuobi, MScPhD StudentinIvana Paunovic, MScDoktorandinEqgugsPgfuüqlyvim-ful_vfiuyziu micand. med. Alexandra Burgercand. med. Philipp HankeFöFoLe Doktorandcand. med. Christoph Lütke-Daldrupcand. med. Bianca Seitzcand. med. Jennifer Tapp
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Laufende Projekte
Projekt „DynamicKit“ im Rahmen des Forschungsnetzwerks BayResQnetDas prestigeträchtige Forschungsvorhaben „DynamicKit“ im Rahmen des Forschungsnetzwerks BayResQnet wurde erfolgreich gestartet. Im Rahmen dieses Projektes werden die Umsatzkinetiken der Proteine von Mykobakterien untersucht und mit Hilfe Künstlicher Intelligenz (KI) basierter Algorithmen ausgewertet. Das Projekt findet in Kooperation mit dem Helmholtz Zentrum und der Mikrobiologie des Max von Pettenkofer-Institutes statt.
SARS-CoV-2 DiagnostikforschungIm Rahmen der Bekämpfung der SARS-CoV-2 Pandemie wurde ein neuer Laborabschnitt aufgebaut, der sich primär mit dem Immuno-Monitoring nach COVID-19 oder entsprechenden Impfungen beschäftigt. Hierbei konnte in Kooperation mit externen Partnern und Firmen eine große Bandbreite an Tests etabliert und evaluiert werden. Außerdem wurde ein Verfahren zur Messung von SARS-CoV-2 Titern aus trockenen Blutstropfen etabliert (DBS: engl. Dried Blood Spots) die eine Heimtestung auf Antikörper mit hoher Zuverlässigkeit erlaubt.
COVID-19 Abwasser-Monitoring ProjektDie Forschungsgruppe entwickelte ein Abwasser-Monitoring Protokoll, das seit April 2020 umgesetzt wurde und wöchentlich die Last von SARS-CoV-2 Viren im Abwasser an 6 verschiedenen Stellen des Münchner Abwassernetzes bestimmt. Damit konnte die Pandemie verfolgt werden. In Zusammenarbeit mit der Virologie des Max von Pettenkofer-Institutes wurden die Analysen weiter verfeinert und auch mittels Sequenzierungen in Kooperation mit dem Genzentrum der LMU (vgl. auch Kooperationspartner/Finanzierung).
Bay-VOC - SARS-CoV-2 Abwassermonitoring in Bayern:
Die Karte der Bay-VOC-Initiative zeigt eine Übersicht der Viruslast im Abwasser in Bayern.Meldungen zum Projekt
Das Projekt wird auch durch das europaweite Konsortium ORCHESTRA finanziert. Das ORCHESTRA-Projekt wurde mit Mitteln aus dem Forschungs- und Innovationsprogramm Horizont 2020 der Europäischen Union unter der Finanzhilfevereinbarung Nr. 101016167 gefördert. Die Verantwortung für den Inhalt dieser Publlikation trägt allein der Verfasser; die Kommission haftet nicht für die weitere Verwendung der darin enthaltenen Angaben.
Neue Strategien gegen Tuberkulose (DZIF-Projekte) -
Förderungen beinhalten Mittel und Projekte u.a. von:
- Deutsches Zentrum für Infektionsforschung (DZIF)
- Forschungsförderung der LMU
- Friedrich-Baur-Institut
- DFG-Kooperationsprojekt mit Prof. Dr. Haisch
- ESTHER-Kooperationsprojekt mit Dr. med. Arne Kroidl
- BayResQNet
- Bayerische Staatskanzlei (SARS-CoV-2 Projekte)
- Horizon 2020 (ORCHESTRA)
- Bayrisches Staatsministerium für Wirtschaft, Landesentwicklung und Energie (Pandemic Preparedness)
- Roche
Kooperationspartner Abwasser-Monitoring-Projekt:
- Center for International Health (CIH), LMU Klinikum München
- Deutsches Zentrum für Infektionsforschung (DZIF), Standort München
- Münchner Stadtentwässerung
- Branddirektion München
- Gesundheitsreferat der Stadt München
- Task Force Infektiologie, Bayerisches Landesamt für Gesundheit und Lebensmittelsicherheit (LGL)
- Genzentrum der LMU München
- Max von Pettenkofer-Institut für Virologie, LMU
- Helmholtz Munich, Institute of Computational Biology (ICB)
Das Abwasser-Monitoring-Projekt wird auch durch das europaweite Konsortium ORCHESTRA finanziert. Das ORCHESTRA-Projekt wurde mit Mitteln aus dem Forschungs- und Innovationsprogramm Horizont 2020 der Europäischen Union unter der Finanzhilfevereinbarung Nr. 101016167 gefördert. Die Verantwortung für den Inhalt dieser Publlikation trägt allein der Verfasser; die Kommission haftet nicht für die weitere Verwendung der darin enthaltenen Angaben.
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2022:
The interplay of viral loads, clinical presentation, and serological responses in SARS-CoV-2 - Results from a prospective cohort of outpatient COVID-19 cases.
Puchinger K, Castelletti N, Rubio-Acero R, Geldmacher C, Eser TM, Deák F, Paunovic I, Bakuli A, Saathoff E, von Meyer A, Markgraf A, Falk P, Reich J, Riess F, Girl P, Müller K, Radon K, Guggenbuehl Noller JM, Wölfel R, Hoelscher M, Kroidl I, Wieser A, Olbrich L; KoCo19 study group.
Virology. 2022 Apr;569:37-43. (IF ca. 3,62)Protective immune trajectories in early viral containment of non-pneumonic SARS-CoV-2 infection.
Pekayvaz K, Leunig A, Kaiser R, Joppich M, Brambs S, Janjic A, Popp O, Nixdorf D, Fumagalli V, Schmidt N, Polewka V, Anjum A, Knottenberg V, Eivers L, Wange LE, Gold C, Kirchner M, Muenchhoff M, Hellmuth JC, Scherer C, Rubio-Acero R, Eser T, Deák F, Puchinger K, Kuhl N, Linder A, Saar K, Tomas L, Schulz C, Wieser A, Enard W, Kroidl I, Geldmacher C, von Bergwelt-Baildon M, Keppler OT, Munschauer M, Iannacone M, Zimmer R, Mertins P, Hubner N, Hoelscher M, Massberg S, Stark K, Nicolai L.
Nat Commun. 2022 Feb 23;13(1):1018. (IF ca. 14,9)SARS-CoV-2 Beta variant infection elicits potent lineage-specific and cross-reactive antibodies.
Reincke SM, Yuan M, Kornau HC, Corman VM, van Hoof S, Sánchez-Sendin E, Ramberger M, Yu W, Hua Y, Tien H, Schmidt ML, Schwarz T, Jeworowski LM, Brandl SE, Rasmussen HF, Homeyer MA, Stöffler L, Barner M, Kunkel D, Huo S, Horler J, von Wardenburg N, Kroidl I, Eser TM, Wieser A, Geldmacher C, Hoelscher M, Gänzer H, Weiss G, Schmitz D, Drosten C, Prüss H, Wilson IA, Kreye J.
Science. 2022 Feb 18;375(6582):782-787. (IF ca. 47,7)Diagnostic Challenges of Helicobacter pylori Infection in Ethiopia: A Community-Based Cross-Sectional Study.
Gudina EK, Amare H, Ali S, Berhane Arefayine M, Tewolde D, Tesfaye Eshete M, Jebena MG, Wieser A, Froeschl G, Tesfaye M, Desalegn H, Gashaw M.
Can J Gastroenterol Hepatol. 2022 Jun 2;2022:4013020. doi: 10.1155/2022/4013020. eCollection 2022.PMID: 36247045Depression among people with dyspepsia and H. pylori infection: A community based cross-sectional study in Ethiopia.
Soboka M, Gudina EK, Gashaw M, Amare H, Berhane M, Desalegn H, Tewolde D, Jebena MG, Ali S, Wieser A, Froeschl G, Tesfaye M.
PLoS One. 2022 Oct 6;17(10):e0275424. doi: 10.1371/journal.pone.0275424. eCollection 2022.PMID: 36201454International Travel as a Risk Factor for Carriage of Extended-Spectrum β-Lactamase-Producing Escherichia coli in a Large Sample of European Individuals-The AWARE Study.
Rodríguez-Molina D, Berglund F, Blaak H, Flach CF, Kemper M, Marutescu L, Pircalabioru Gradisteanu G, Popa M, Spießberger B, Wengenroth L, Chifiriuc MC, Larsson DGJ, Nowak D, Radon K, de Roda Husman AM, Wieser A, Schmitt H.
Int J Environ Res Public Health. 2022 Apr 14;19(8):4758. doi: 10.3390/ijerph19084758.PMID: 35457624Community Wastewater-Based Surveillance Can Be a Cost-Effective Approach to Track COVID-19 Outbreak in Low-Resource Settings: Feasibility Assessment for Ethiopia Context.
Ali S, Gudina EK, Gize A, Aliy A, Adankie BT, Tsegaye W, Hundie GB, Muleta MB, Chibssa TR, Belaineh R, Negessu D, Shegu D, Froeschl G, Wieser A.
Int J Environ Res Public Health. 2022 Jul 12;19(14):8515. doi: 10.3390/ijerph19148515.PMID: 35886369Prevalence and intensity of soil-transmitted helminth infections and associated risk factors among household heads living in the peri-urban areas of Jimma town, Oromia, Ethiopia: A community-based cross-sectional study.
Zeynudin A, Degefa T, Tesfaye M, Suleman S, Yesuf EA, Hajikelil Z, Ali S, Azam K, Husen A, Yasin J, Wieser A.
PLoS One. 2022 Sep 15;17(9):e0274702. doi: 10.1371/journal.pone.0274702. eCollection 2022.PMID: 36107925Determinants of anti-S immune response at 6 months after COVID-19 vaccination in a multicentric European cohort of healthcare workers - ORCHESTRA project.
Collatuzzo G, Visci G, Violante FS, Porru S, Spiteri G, Monaco MGL, Larese Fillon F, Negro C, Janke C, Castelletti N, De Palma G, Sansone E, Mates D, Teodorescu S, Fabiánová E, Bérešová J, Vimercati L, Tafuri S, Abedini M, Ditano G, Asafo SS, Boffetta P; Orchestra WP5 Working Group.
Front Immunol. 2022 Sep 29;13:986085. doi: 10.3389/fimmu.2022.986085. eCollection 2022.PMID: 36248889Surveillance of Acute SARS-CoV-2 Infections in Elementary Schools and Daycare Facilities in Bavaria, Germany (09/2020-03/2021).
Kern A, Kuhlmann PH, Matl S, Ege M, Maison N, Eckert J, von Both U, Behrends U, Anger M, Frühwald MC, Gerstlauer M, Woelfle J, Neubert A, Melter M, Liese J, Goettler D, Sing A, Liebl B, Hübner J, Klein C; COVID Kids Bavaria Consortium.
Front Pediatr. 2022 Jul 6;10:888498. doi: 10.3389/fped.2022.888498. eCollection 2022.PMID: 35874561Enhanced Spike-specific, but attenuated Nucleocapsid-specific T cell responses upon SARS-CoV-2 breakthrough versus non-breakthrough infections.
Ahmed MIM, Diepers P, Janke C, Plank M, Eser TM, Rubio-Acero R, Fuchs A, Baranov O, Castelletti N, Kroidl I, Olbrich L, Bauer B, Wang D, Prelog M, Liese JG, Reinkemeyer C, Hoelscher M, Steininger P, Überla K, Wieser A, Geldmacher C.
Front Immunol. 2022 Dec 13;13:1026473. doi: 10.3389/fimmu.2022.1026473. eCollection 2022.PMID: 36582222Distinct and dynamic activation profiles of circulating dendritic cells and monocytes in mild COVID-19 and after yellow fever vaccination.
Winheim E, Eser T, Deák F, Ahmed MIM, Baranov O, Rinke L, Eisenächer K, Santos-Peral A, Karimzadeh H, Pritsch M, Scherer C, Muenchhoff M, Hellmuth JC, von Bergwelt-Baildon M, Olbrich L, Hoelscher M, Wieser A, Kroidl I, Rothenfusser S, Geldmacher C, Krug AB.
Eur J Immunol. 2022 Nov 20. doi: 10.1002/eji.202250090. Online ahead of print.PMID: 364040542021:
Carriage of ESBL-producing Enterobacterales in wastewater treatment plant workers and surrounding residents - the AWARE Study.
Rodríguez-Molina D, Berglund F, Blaak H, Flach CF, Kemper M, Marutescu L, Gradisteanu GP, Popa M, Spießberger B, Weinmann T, Wengenroth L, Chifiriuc MC, Larsson DGJ, Nowak D, Radon K, de Roda Husman AM, Wieser A, Schmitt H.
Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2021 Dec 13:1-16. (IF ca. 3,02)Community SARS-CoV-2 seroprevalence before and after the second wave of SARS-CoV-2 infection in Harare, Zimbabwe.
Fryatt A, Simms V, Bandason T, Redzo N, Olaru ID, Ndhlovu CE, Mujuru H, Rusakaniko S, Hoelscher M, Rubio-Acero R, Paunovic I, Wieser A, Chonzi P, Masunda K, Ferrand RA, Kranzer K.
EClinical medicine Volume 4, 101172, November 01, 2021 (IF ca. 3,5)Seroepidemiology and model-based prediction of SARS-CoV-2 in Ethiopia: longitudinal cohort study among front-line hospital workers and communities.
Gudina EK*, Ali S*, Girma E, Gize A, Tegene B, Hundie GB, Sime WT, Ambachew R, Gebreyohanns A, Bekele M, Bakuli A, Elsbernd K, Merkt S, Contento L, Hoelscher M, Hasenauer J, Wieser A*, Kroidl A*.
Lancet Glob Health. 2021 Nov;9(11):e1517-e1527 (*: shared authorships) (IF 26,7)Spatially resolved qualified sewage spot sampling to track SARS-CoV-2 dynamics in Munich - One year of experience.
Rubio-Acero R*, Beyerl J*, Muenchhoff M, Roth MS, Castelletti N, Paunovic I, Radon K, Springer B, Nagel C, Boehm B, Böhmer MM, Graf A, Blum H, Krebs S, Keppler OT, Osterman A, Khan ZN, Hoelscher M, Wieser A; KoCo19-Study Group.
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Olbrich L*, Castelletti N*, Schälte Y*, Garí M*, Pütz P, Bakuli A, Pritsch M, Kroidl I, Saathoff E, Guggenbuehl Noller JM, Fingerle V, Le Gleut R, Gilberg L, Brand I, Falk P, Markgraf A, Deák F, Riess F, Diefenbach M, Eser T, Weinauer F, Martin S, Quenzel EM, Becker M, Durner J, Girl P, Müller K, Radon K, Fuchs C, Wölfel R*, Hasenauer J*, Hoelscher M*, Wieser A*; On Behalf Of The KoCo-Study Group.
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Radon K, Bakuli A, Pütz P, Le Gleut R, Guggenbuehl Noller JM, Olbrich L, Saathoff E, Garí M, Schälte Y, Frahnow T, Wölfel R, Pritsch M, Rothe C, Pletschette M, Rubio-Acero R, Beyerl J, Metaxa D, Forster F, Thiel V, Castelletti N, Rieß F, Diefenbach MN, Fröschl G, Bruger J, Winter S, Frese J, Puchinger K, Brand I, Kroidl I, Wieser A*, Hoelscher M*, Hasenauer J*, Fuchs C*; KoCo19 study group.
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Rubio-Acero R*, Castelletti N*, Fingerle V, Olbrich L, Bakuli A, Wölfel R, Girl P, Müller K, Jochum S, Strobl M, Hoelscher M, Wieser A; KoCo19 study team.
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Brand I*, Gilberg L*, Bruger J*, Garí M, Wieser A, Eser TM, Frese J, Ahmed MIM, Rubio-Acero R, Guggenbuehl Noller JM, Castelletti N, Diekmannshemke J, Thiesbrummel S, Huynh D, Winter S, Kroidl I, Fuchs C, Hoelscher M*, Roider J*, Kobold S*, Pritsch M*, Geldmacher C*.
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Melaku T, Gashaw M, Chelkeba L, Berhane M, Bekele S, Lemi G, Wakjira T, Tesfaw G, Mekonnen Z, Ali S, Kroidl A, Wieser A, Froeschl G, Gudina EK.
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Wengenroth L, Berglund F, Blaak H, Chifiriuc MC, Flach CF, Pircalabioru GG, Larsson DGJ, Marutescu L, van Passel MWJ, Popa M, Radon K, de Roda Husman AM, Rodríguez-Molina D, Weinmann T, Wieser A, Schmitt H.
Antibiotics (Basel). 2021 Apr 21;10(5):478. (IF 3,89)Prevalence and Risk Factors of Infection in the Representative COVID-19 Cohort Munich.
Pritsch M*, Radon K*, Bakuli A*, Le Gleut R*, Olbrich L, Guggenbüehl Noller JM, Saathoff E, Castelletti N, Garí M, Pütz P, Schälte Y, Frahnow T, Wölfel R, Rothe C, Pletschette M, Metaxa D, Forster F, Thiel V, Rieß F, Diefenbach MN, Fröschl G, Bruger J, Winter S, Frese J, Puchinger K, Brand I, Kroidl I, Hasenauer J*, Fuchs C*, Wieser A*, Hoelscher M*, On Behalf Of The KoCo Study Group.
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Pritsch M, Ben Khaled N, Liegl G, Schubert S, Hoelscher M, Woischke C, Arens N, Thorn-Seshold J, Kammermeier S, Wieser A.
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Regional Variation of Extended-Spectrum Beta-Lactamase (ESBL)-Producing Enterobacterales, Fluoroquinolone-Resistant Salmonella enterica and Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Among Febrile Patients in Sub-Saharan Africa .
Moirongo RM, Lorenz E, Ntinginya NE, Dekker D, Fernandes J, Held J, Lamshöft M, Schaumburg F, Mangu C, Sudi L, Sie A, Souares A, Heinrich N, Wieser A, Mordmüller B, Owusu-Dabo E, Ayola Adegnika A, Coulibaly B, May J, Eibach D.
Front Microbiol. 2020; 11: 567235.Protocol of a population-based prospective COVID-19 cohort study Munich, Germany (KoCo19) .
Radon K, Saathoff E, Pritsch M, Guggenbühl Noller JM, Kroidl I, Olbrich L, Thiel V, Diefenbach M, Riess F, Forster F, Theis F, Wieser A, Hoelscher M, the KoCo19 collaboration group.
BMC Public Health. 2020; 20: 1036.Publisher Correction to: Protocol of a population-based prospective COVID-19 cohort study Munich, Germany (KoCo19).
Radon K, Saathoff E, Pritsch M, Guggenbühl Noller JM, Kroidl I, Olbrich L, Thiel V, Diefenbach M, Riess F, Forster F, Theis F, Wieser A, Hoelscher M; KoCo19 collaboration group.
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Übersichtsarbeit - Der Mikrobiologe März 2018Cloning and plant-based production of antibody MC10E7 for a lateral flow immunoassay to detect [4-arginine]microcystin in freshwater.
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