Infektionsimmunologie (Infection & Immunity)
Die Arbeitsgruppe "Infektion & Immunität" konzentriert sich auf die Erforschung der Wirtsantwort auf Infektion und Impfung im Rahmen von Kohortenstudien am Menschen mit Schwerpunkt auf SARS-CoV2-Infektionen, dem Humanen Immundefizienz-Virus (HIV), onkogenen Humanen Papillomaviren (HPV), Mycobacterium tuberculosis (MTB) und Helmintheninfektionen (gemeinsam mit AG Inge Kroidl). Dazu gehören die molekulare Charakterisierung des infektiösen Erregers, die Identifizierung von Korrelaten des Immunschutzes vor Infektion und Krankheitsverlauf, die Entdeckung von Biomarkern für die TB-Diagnostik und Therapieüberwachung, die Charakterisierung von HIV-Reservoiren sowie die Kartierung von B-Zell-Epitopen nach Impfung. Neben der Analyse systemischer zellulärer und humoraler Immunantworten verfügt die Gruppe über Kenntnisse in der Analyse von Effektorzelluntergruppen in menschlichen Gewebeproben mittels Multiplex-Fluoreszenz-Immunhistochemie in Kombination mit dem Nachweis viraler Nukleinsäuren mittels In-situ-Hybridisierung zur Untersuchung der Mikroumgebung virusinfizierter Zellen. Die Fähigkeit zur bioinformatischen Analyse großer RNA-Sequenzierungsdaten und Mikroskopiebilder wird weiter ausgebaut.
Analyse diagnostischer RNA Signaturen mittel mittels Mikrofluidik-basierter quantitativer PCR
Immunmonitoring-Labor
Phänotypisierung Pathogen-spezifischer T-Zellen am Durchflusszytometer
Bioinformatische Analyse von Multi-Omic Daten
Das Labor ist mit einem 13-Farben Beckmann Coulter CytoFLEX Durchflusszytometer ausgestattet und verfügt über große Erfahrung in der durchflusszytometrischen Analyse menschlicher Zellen. Dazu gehört die Charakterisierung von pathogen-spezifischen T-Zellen nach in vitro Restimulation oder durch HLA-Tetramer-Färbung sowie aller anderen Zelltypen im Blut. Das Labor verwendet die Durchflusszytometrie-Kerneinheit CyTUM-MIH für die durchflusszytometrische Zellsortierung auf Biosicherheitsstufe S2 und S3, um nachgeschaltete Analysen von DNA und RNA in sortierten Zellen zu ermöglichen.
Das Labor dient als zentrales Peptidarray-Labor für die European HIV Vaccine Alliance. Wir verwenden ein vollständig validiertes Peptid-Mikroarray-Assay zur Kartierung und Analyse spezifischer antigener Regionen, die von den durch die Impfung ausgelösten Antikörpern erkannt werden. Die Technologie ist sowohl für klinische als auch für präklinische Proben geeignet. Die Technologie ermöglicht Reaktivitätstests gegen bis zu 8000 verschiedene Peptide in dreifacher Ausführung in mehreren Proben gleichzeitig. Das Design des Peptid-Microarrays wird in Zusammenarbeit mit Dr. Georgios Pollakis (Universität Liverpool) durchgeführt. Die nachgelagerte bioinformatische Analyse der generierten Daten ist gut etabliert und kann je nach Forschungsfrage angepasst werden.
Die Transkriptomanalyse ist im Labor gut etabliert, wobei die bioinformatischen Arbeitsabläufe im Haus entwickelt wurden. Ein besonderer Schwerpunkt unserer Forschung ist die Analyse von Zellpopulationen mit geringer Häufigkeit, um neue Biomarker zu entdecken. Wir verfügen über Fachwissen in der Hochdurchsatzanalyse von Vollblut, das in klinischen Versuchen und Beobachtungsstudien gesammelt wurde, sowie in der RNA-Sequenzierung von sortierten seltenen Zellpopulationen wie pathogenspezifischen T-Zellen mit geringem Durchsatz.
Das Labor kann Labordienstleistungen für die Verarbeitung und Analyse von Humanproben für klinische Studien in München und anderswo anbieten. Dazu gehört die Aufbereitung von Blutproben (Plasma, Serum, Isolierung peripherer mononukleärer Blutzellen). Die Gruppe hat auch große Erfahrung in der Unterstützung großer internationaler klinischer Studien mit einem besonderen Schwerpunkt auf Afrika. Wir bieten daher Unterstützung bei der Proben- und Reagenzienlogistik, dem Aufbau von Kapazitäten und dem Analyseprozess in verschiedenen nationalen und internationalen Studien. Bitte kontaktieren Sie uns für weitere Informationen.
